Как сделать рамку невидимой в R для функции ggplot geom_col

Я работаю над созданием графика geom_col, который имеет цвета заливки в соответствии с категориями таксонов, и x будет группой, а y - изобилием, это мой код:

sig_counts_rowsample <- data.frame(t(sig_counts))%>%
        merge(.,anno_col,by=0)%>%
        pivot_longer(.,cols=2:(length(.)-1), names_to = "taxa", values_to = "abundance")
      options(scipen=10000)
      p<-ggplot(sig_counts_rowsample) +
        geom_col(aes(x=Group, y=abundance,fill=factor(taxa,levels=bar_sorting)),position = "position_stack(reverse = TRUE)")+
        scale_fill_discrete(name = "Taxa")
      output_name<-paste("Group_statistics/Sig_abundance",mtype,"barplot.svg",sep="_")
      ggsave(output_name,plot=p,device="svg",units="cm",width=35,height=18)

вот как выглядит фрейм данных:

> sig_counts_rowsample
# A tibble: 1,491 x 4
   Row.names Group taxa                                 abundance
   <I<chr>>  <fct> <chr>                                    <dbl>
 1 L1-0      L0    g__Desulfallas_s__gibsoniae                0  
 2 L1-0      L0    g__Streptococcus_s__thermophilus           0  
 3 L1-0      L0    g__Streptococcus_s__agalactiae             0  
 4 L1-0      L0    g__Streptococcus_s__acidominimus           0  
 5 L1-0      L0    g__Clostridium_s__cellulovorans          358. 
 6 L1-0      L0    g__Lactobacillus_s__reuteri               30.4
 7 L1-0      L0    g__Lactobacillus_s__sakei                 40.7
 8 L1-0      L0    g__Lactobacillus_s__alimentarius          49.6
 9 L1-0      L0    g__Hungateiclostridium_s__saccincola       0  
10 L1-0      L0    g__Corynebacterium_s__ammoniagenes        39.2

Я внес некоторые изменения, чтобы отсортировать порядок заполненных цветов и полос. это мой вывод jpg:

вывод ipg

Однако, когда я сохраняю его в формате svg (например, код выше), рамка полосы будет действительно очевидной, и я хочу, чтобы она выглядела так же, как изображение jpg, как мне это сделать?

это скриншот вывода svg (потому что я не могу загрузить файл svg сюда)

вывод svg


person Eric    schedule 25.11.2020    source источник


Ответы (1)


Я предполагаю, что белые линии - это просто белый цвет по умолчанию. В этом случае добавление color=factor(taxa,levels=bar_sorting)должно работать.

Удачи!

person Magnus Nordmo    schedule 25.11.2020