пропустить некоторые строки в read.csv в R

Это возможно с помощью пакета sqldf, используя read.csv.sql

Допустим, содержимое sample.csv выглядит так:

id,name,age
1,"a",23
2,"b",24
3,"c",23

Теперь, чтобы читать только строки, где возраст = 23:

require(sqldf)

df <- read.csv.sql("sample.csv", "select * from file where age=23")

df
  id name age
1  1  "a"  23
2  3  "c"  23

Можно выбрать необходимые столбцы:

df <- read.csv.sql("sample.csv", "select id, name from file where age=23")
df
  id name
1  1  "a"
2  3  "c"

Лучше прочитать все и подмножество позже, как это предлагается в комментарии:

csvData [!csvData$ticker %in% c('ADCT','ABT'),]

ИЗМЕНИТЬ

Вы можете использовать fread из пакета data.table для более эффективного чтения вашего файла.

library(read.table)
fread(file="pf.csv")

На первый взгляд пакет sqldf read.csv.sql выглядел великолепно. Но когда я попытался его использовать, он не смог справиться со строками «NULL». (Другие тоже это обнаружили.) К сожалению, он не поддерживает все функции read.csv. Поэтому мне пришлось написать свой собственный. Я удивлен, что для этого нет хорошего пакета.

fetchLines=function(inputFile,match,fixed=T,n=100,maxlines=100000){ #inputFile='simple.csv'; match='APPLE';
  message('reading:',inputFile)
  n=min(n,maxlines)
  con  <- base::file(inputFile, open = "r",encoding = "UTF-8-BOM")
  data=c(readLines(con, n = 1, warn = FALSE))
  while (length(oneLine <- readLines(con, n = n, warn = FALSE)) > 0) {
    grab=grep(match,oneLine,value=T,fixed=fixed)
    if(length(grab)>0){
      data=c(data,grab)
      if(length(data)>maxlines){
        warning("bailing out too many");
        return(data);
      }
      cat('.')
    }
  } 
  close(con)
  gc()
  cat("\n")
  data;
}

#To avoid: argument 'object' must deparse to a single character string
fdata=textConnection( fetchLines("datafile.csv",'\\bP58\\b',fixed=F,maxlines = 100000))
df<-read.csv(fdata,header=T,sep=",",na.strings = c('NULL',''),fileEncoding = "UTF-8-BOM",stringsAsFactors = F)

R textConnection: аргумент "объект" должен разобрать строка из одного символа