Настройка среды разработки java/j2ee с помощью: Eclipse, Tomcat и Vagrant

Какими файлами/папками я должен поделиться? (полагаю, не все рабочее пространство eclipse)

ИМХО, доли the project you are working on достаточно. Таким образом, у вас может быть одна виртуальная машина для каждого проекта.

У вас есть два варианта для создания войны:

1. строить на хосте;
2. сборка на ВМ (предпочтительно).

Если вы выберете Option 1: поскольку папка вашего проекта используется совместно с виртуальной машиной, вы можете скопировать войну в $CATALINA_HOME/webapps после подключения к виртуальной машине по ssh.

Я бы предложил Option 2, потому что вы можете максимально приблизить среду сборки к вашей производственной среде.

Что мне лучше использовать: взорванный или обычный военный архив?

Я бы использовал обычный военный архив, но тут особой разницы нет.

Как настроить Eclipse (находящийся на хосте) для просмотра удаленного Tomcat (находящегося на гостевой системе).

Здесь у вас есть два варианта:

1. Настроить перенаправление портов в vagrantfile;
2. Настройте частную сеть, что является моим предпочтительным способом, поскольку вам не нужно перенаправлять каждый отдельный порт вручную, если с хост-компьютера необходимо получить доступ к нескольким службам, работающим на виртуальной машине.

Как настроить сети только для хоста

config.vm.network "hostonly", "192.168.0.0"

Эта строка в вашем Vagrantfile будет указывать vagrant на создание частной сети со статическим IP-адресом: 192.168.0.0

IP-адрес хоста всегда один и тот же IP-адрес, но с последним октетом, равным 1. В предыдущем примере хост-машина будет иметь IP-адрес 192.168.0.1.