Где следует вызывать EntityManager::persist() и EntityManager::flush()

Я разрабатываю приложение среднего масштаба, используя Symfony2 и Doctrine2. Я пытаюсь максимально структурировать свой код в соответствии с принципами SOLID. Теперь вот вопрос:
Для создания новых сущностей я использую Symfony Forms с прокси-объектами, то есть: я не привязываю форму непосредственно к моей сущности, а к другому классу, который будет передан к какой-либо службе, которая предпримет необходимые действия на основе полученных данных, то есть: прокси-класс служит DTO для этой службы, которую я назову Handler. Теперь, учитывая, что Handler не зависит от EntityManager, где мне делать вызовы EntityManager::persist() и EntityManager::flush()? Обычно мне удобно помещать flush в контроллер, но я не уверен в persist, так как контроллер не должен ничего предполагать о том, что делает Handler, и, возможно, Handler::handle (метод, которому передаются данные формы) делает больше, чем просто сохраните новую сущность в базе данных. Одна идея состоит в том, чтобы создать несколько interfaces для инкапсуляции flush и persist и передачи их, которые будут действовать как обертки вокруг EntityManager::flush() и EntityManager::persist(), но я не уверен в этом, поскольку EntityManager::flush() может привести к нежелательным последствиям. Так что, может быть, я должен просто создать интерфейс вокруг persist.
Итак, мой вопрос: где и как сделать вызов persist и flush, чтобы получить наиболее надежный код? Или я просто все усложняю в поисках лучших практик?