Перенаправление вывода и графиков R

Я использую Sweave и LaTex для создания отчетов из вывода R и графиков. Но иногда требуется иметь графики в редактируемом формате. Я попробовал пакет R2wd, но с ggplot2 он не кажется очень гибким. Я был бы очень признателен, если бы кто-нибудь указал мне несколько эффективных способов. Спасибо


r ggplot2 latex
person MYaseen208    schedule 27.08.2011    source источник
comment
О, я бы хотел что-то подобное. Лучшее, что я сделал, это сделал супер-короткие R-скрипты, которые ничего не делают, кроме построения графика, так что вы можете модифицировать скрипт. Но мне бы понравилось, если бы был более дружелюбный способ (я работаю с людьми, которые не программируют).   -  person Owen    schedule 27.08.2011
comment
Я могу неправильно понять это. Можете ли вы уточнить, что вы подразумеваете под редактируемым? Например. Вы хотите, чтобы изображения сохранялись в файлы?   -  person Iterator    schedule 27.08.2011
comment
Здесь под редактируемыми средствами можно копировать из одного файла в другой.   -  person MYaseen208    schedule 27.08.2011
comment
Это похоже на дубликат вашего вопроса stackoverflow.com/questions/ 7212627/ спросил примерно в то же время. Я опубликовал ответ на этот вопрос.   -  person PaulHurleyuk    schedule 27.08.2011

Ответы (2)


arrow_upward
4
arrow_downward

Это действительно зависит от того, что вы подразумеваете под «редактируемым» и о каких файлах/конечных точках вы говорите. Существует множество дискуссий (например, это R- ветку помощи от 2006 года) о (1) лучших вариантах создания рисунков для встраивания в Word (или PowerPoint, что в значительной степени является тем же вопросом) и (2) лучших вариантах рисунков, которые можно редактировать (путем что я имею в виду, что они могут быть изменены пользователями, не являющимися пользователями R, а не просто перемещены из файла в файл). Общие выводы, которые я увидел, таковы:

  • PDF-файлы: векторный формат, редактируемый в Adobe Illustrator ($$$), встраивается только в документы MS Office
  • Метафайлы Windows или расширенные метафайлы (WMF/EMF): векторный формат, очень ограниченная поддержка за пределами платформы Windows. Несколько шаткий формат, но родной для MS Office. Конечно, будет ограниченная поддержка таких вещей, как альфа-каналы (прозрачность).
  • SVG: векторный формат. Очень современный, редактируемый в Inkscape (не знаю, где еще), не особенно совместимый с MS Office (я думаю). (Создается как минимум с помощью пакета Cairo.)
  • PNG: растровый формат, но очень компактный (вы можете сделать разрешение абсурдно большим и при этом иметь достаточно маленький выходной файл); вероятно, самое простое / решение с наименьшим общим знаменателем, если вам нужна только переносимость, а не редактируемость.

Начиная с R 2.13.0, Sweave может автоматически генерировать файлы PDF и PNG на лету для каждого фрагмента фигуры. Если это сохранено как документ foo.Rnw:

\documentclass{article}
\begin{document}

\SweaveOpts{png=TRUE,pdf=TRUE,eps=FALSE}
<<fig1,fig=TRUE>>=
plot(1:5,1:5,col=1:5,pch=16)
@

\end{document}

... то после Sweaveing ваш каталог будет содержать файлы foo-fig1.png и foo-fig1.pdf. Я не знаю, отвечает ли это на ваш вопрос, но ваш вопрос не совсем ясен...

person Ben Bolker    schedule 27.08.2011

arrow_upward
4
arrow_downward

Пакет pgfSweave связывает вместе Sweave с tikzDevice. tikzDevice использует пакет LaTeX tikz, чтобы поместить инструкции по рисованию графика в код LaTeX. Таким образом, вы можете скопировать полученный код из одного файла в другой. pgfSweave также добавляет некоторые удобные функции, такие как кеширование.

Вы также можете просто вывести PDF-файлы своих графиков с помощью pdf(), а затем вставить код LaTeX, чтобы загрузить эти графики в виде рисунков. Тем не менее, вы теряете автоматизированное управление файлами Sweave.

person Ari B. Friedman    schedule 27.08.2011