Определить, закреплено ли приложение на панели задач

Вы можете определить, закреплено ли приложение на панели задач для текущего пользователя, проверив папку %appdata%\Microsoft\Internet Explorer\Quick Launch\User Pinned\TaskBar, где хранятся ярлыки для всех закрепленных приложений. Например (необходимо добавить ссылку COM на объектную модель хоста сценариев Windows):

private static bool IsCurrentApplicationPinned() {
    // path to current executable
    var currentPath = Assembly.GetEntryAssembly().Location;            
    // folder with shortcuts
    string location = Path.Combine(Environment.GetFolderPath(Environment.SpecialFolder.ApplicationData), @"Microsoft\Internet Explorer\Quick Launch\User Pinned\TaskBar");
    if (!Directory.Exists(location))
        return false;

    foreach (var file in Directory.GetFiles(location, "*.lnk")) {
        IWshShell shell = new WshShell();
        var lnk = shell.CreateShortcut(file) as IWshShortcut;
        if (lnk != null) {  
            // if there is shortcut pointing to current executable - it's pinned                                    
            if (String.Equals(lnk.TargetPath, currentPath, StringComparison.InvariantCultureIgnoreCase)) {
                return true;
            }
        }
    }
    return false;
}

Существует также способ определить, было ли приложение запущено из закрепленного элемента или нет. Для этого вам понадобится GetStartupInfo функция win api. Помимо другой информации, он предоставит вам полный путь к ярлыку (или просто файлу), с которого был запущен текущий процесс. Пример:

[DllImport("kernel32.dll", SetLastError = true, EntryPoint = "GetStartupInfoA")]
public static extern void GetStartupInfo(out STARTUPINFO lpStartupInfo);

[StructLayout(LayoutKind.Sequential, CharSet = CharSet.Ansi)]
public struct STARTUPINFO
{
    public uint cb;
    public string lpReserved;
    public string lpDesktop;
    public string lpTitle;
    public uint dwX;
    public uint dwY;
    public uint dwXSize;
    public uint dwYSize;
    public uint dwXCountChars;
    public uint dwYCountChars;
    public uint dwFillAttribute;
    public uint dwFlags;
    public ushort wShowWindow;
    public ushort cbReserved2;
    public IntPtr lpReserved2;
    public IntPtr hStdInput;
    public IntPtr hStdOutput;
    public IntPtr hStdError;
}

Использование:

STARTUPINFO startInfo;
GetStartupInfo(out startInfo);
var startupPath = startInfo.lpTitle;

Теперь, если вы запустили приложение с панели задач, startupPath будет указывать на ярлык с %appdata%\Microsoft\Internet Explorer\Quick Launch\User Pinned\TaskBar, поэтому со всей этой информацией легко проверить, было ли приложение запущено с панели задач или нет.